مدرسه علميه الزهرا (س) در سال 1360 با عنايت و درايت حضرت آيت الله العظمي نور مفيدی (حفظه الله) با توجه به نقش مؤثر زنان در مقابله با تهاجم فرهنگی و پيشگيری از انحرافات اجتماعی و توانمندی زنان در سازندگی فرهنگی جامعه تأسيس شد. مؤسس محترم انگيزه خود را از تأسيس مدرسه اينگونه بيان فرمودهاند:
«تحصيل علم برای مرد و زن فرقی نميکند و هر دو موظفند که خود را به زينت علم آراسته کنند ولی بيشترين عاملی که باعث شد مدرسه علميه الزهرا(س) را تأسيس کنيم اين بود که ميديديم سطح بينش دينی خواهران پايين است و مجالس و محافلی که در سطح شهرستانها از ناحيه خواهران برگزار ميشود کم محتوا يا بی محتواست؛ اين مسئله مرا رنج ميداد و از مدتها قبل خيلی علاقه داشتم تحولی در ميان خواهران ايجاد شود و خانمها با تحصيل معارف دينی وارد جامعۀ بانوان شوند و آمادگيهای دينی و اجتماعی آنان را بالاتر برند و خلاصه رسولانی از خود خواهران به سوی آنان باشند، اين بود که مدرسه را تأسيس کرديم و بحمدالله همانطوری که پيش بينی ميکرديم وجود اين مدرسه و خواهران تحصيل کرده در آن هدفی که داشتم، بسيار مؤثر و مفيد بوده است.»